====== Amélioration de la robustesse d'algorithmes d'analyse automatique d'images biomédicales ======
Notre équipe développe des méthodes génériques de classification
et de segmentation automatique d'images basée sur l'apprentissage
automatique et les applique sur des problèmes concrets.
Dans le domaine biomédical, les procédures d'acquisition d'images
peuvent être variables (allant des protocoles expérimentaux aux
microscopes générant les images) et peuvent produire des images aux
caractéristiques différentes (résolution par pixel, intensités et couleurs des pixels,
luminosité, contraste, etc.) pour un même échantillon, comme illustré ci-dessous. En pratique l'utilisation de
méthode d'analyse d'images est parfois limitée par le manque de robustesse
des algorithmes vis-à-vis de ces variations.
Le but de ce travail est d'évaluer la robustesse d'un algorithme proposé
par notre équipe (basé sur des arbres de décision), de mieux caractériser les variations découlant des
procédures d'acquisition, et d'adapter l'algorithme pour le rendre
davantage robuste dans le contexte d'images cellulaires et tissulaires
en très haute résolution (plusieurs dizaines de milliers de pixels de
haut et de large). En cancérologie, ces algorithmes peuvent être utilisés pour
aider les experts médecins à mesurer l'effet de traitements ou faire du dépistage précoce de maladies.
====== Bibliographie ======
* [[http://www.montefiore.ulg.ac.be/services/stochastic/pubs/2007/MGW07/maree-geurts-wehenkel-bmc-cell-biology-1471-2121-8-S1-S2.pdf|Marée et al., Random Subwindows and Extremely Randomized Trees for Image Classification in Cell Biology, 2007]]
====== Profil ======
Nous recherchons un étudiant motivé par l'imagerie, le traitement d'images,
l'apprentissage automatique (arbres de décision) pour l'analyse d'images, les gros
volumes de données, et concerné par l'utilité pratique de son travail
et de son code. L'étudiant pourra réaliser son travail au sein de
l'équipe au GIGA et bénéficier de son infrastructure informatique de
pointe.
====== Renseignements ======
[[http://www.montefiore.ulg.ac.be/~maree/|Raphaël Marée]] ()